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污水 河流和土壤為抗生素耐藥性提供了缺失的聯系

2019-10-30 14:47:16 編輯: 來源:
導讀 如果您認為擊敗抗生素耐藥性的關鍵只是減少醫生開處方,讓科學家找到新的候選藥物,那您可能是錯的。在管理我們的河流和土壤方面,根本解決

如果您認為擊敗抗生素耐藥性的關鍵只是減少醫生開處方,讓科學家找到新的候選藥物,那您可能是錯的。在管理我們的河流和土壤方面,根本解決方案可能遠非醫學。

這是科學家的觀點,他們發現了過去十年來河流和廢水中令人不安的抗生素和抗藥性細菌數量。現在,他們正在開發量化任何特定水域中所包含危險的技術,并且他們希望這可以促使決策者采取行動。

英國伯明翰大學微生物學和感染學專家威廉·范·舍克教授(Willem van Schaik教授)說,抗生素殘留物進入環境的一種方式是人們將它們從糞便和尿液中排泄出去。不僅是藥物:引起抗生素感染的病原菌也會搭便車-其中一部分對藥物有抵抗力。

在較貧窮的國家,超過80%的污水未經處理就排放到環境中。在喀麥隆首都雅溫得,雅溫得大學的環境微生物學家Blaise Bougnom博士一直在拼湊一條特定的污水處理路線:人類廢物經常直接進入城市的運河,城市農民從那里取水灌溉重要的農作物用于城市居民的蔬菜供應。

都市農業

在較貧窮的國家中,城市農業普遍存在,在路邊,排水渠,回旋處和公園中種植蔬菜。它可以提供一個城市40%的糧食供應,以及高達90%的蔬菜需求。

布諾姆醫生說,雅溫得醫院的抗生素耐藥性感染呈“令人警覺”的水平。

他說:“我與一些醫生討論過。” “我開始認為我們在臨床環境中所看到的與環境中所發生的事情之間可能存在某種聯系。然后,我開發了這個項目,研究了廢水傳播AMR(抗菌素耐藥性)的潛力。”

在伯明翰大學期間,他開始研究,研究喀麥隆瓦加杜古,布基納法索,雅溫得和恩加德雷等城市的灌溉用水。他分析了水中存在的基因,并發現了許多與引起人類腹瀉的細菌有關的基因。他還發現了許多與抗生素抗性有關的基因,其中包括80多個已知容易在細菌之間轉移的基因,以及能夠轉移它們的實體(例如質粒)。

然后,他比較了這些城市中的城市田地,發現原水灌溉的田地比未灌溉的田地擁有更多的抗生素和抗性基因。

他說:“這是非常悲慘的,因為本來可以帶來很多解決方案的(城市農業),實際上也可能帶來很多問題。”

載有大量耐藥性廢水的另一個有效來源可能是醫院污水。

van Schaik教授表示,在世界范圍內,醫院中的抗生素使用量可能會更高-在歐洲,三分之一的住院患者在任何時間都在服用抗生??素,而美國的這一數字是一半。因此,廢水(包括抗生素和抗藥性細菌)的負荷可能很高。

van Schaik教授說:“您可以將它(醫院的污水處理系統)視為管道,整個細菌生態系統都在墻壁上生長。” “這些生態系統將經過優化,以在流經這些系統的污水條件下生長,并且由于抗生素的水平很高-幾乎比其他任何地方都高-這些細菌將在高水平的抗生素存在下適應生活”。

目前尚不清楚廢水的負荷量,以及因此面臨的問題的大小,但未知的是基因組學專家,范·謝克教授的同事Lisandra Zepeda Mendoza博士希望通過研究這種細菌的遺傳物質來改變這種狀況。該名為ARCS的生態系統中的微生物。

有風險

她一直在分析從醫院污水罐中發現的各種細菌和病毒的DNA,尋找與細菌和噬菌體之間的抗性轉移相關的基因等元素,這些病毒可以在細菌之間轉移遺傳物質。要了解樣品的風險,重要的是不僅要了解存在哪些抗性基因,還要了解它們的可傳播性,這取決于還存在哪些其他基因。

她說:“我可以識別出那里的細菌,它們具有的基因以及它們可以做什么。”

她將這些結果以及醫院廢水的其他分析數據輸入到機器學習模型中,該模型可以推斷出在任何特定來源中抵抗力威脅的有效程度。

如果她的方法成功,則可以用來比較不同來源的相對危險,例如,靠近藥廠或醫院的河流,城市運河和灌溉水。

她說:“實際上并沒有一種以標準化方式比較不同環境的方法。”

van Schaik教授補充說:“我所在領域的人們一直在爭論什么是最有效的干預措施,什么是最重要的工作,而答案很短,我們不知道。

“我認為,通過這種方法,我們至少能夠對不同環境進行風險評估,不僅是廢水,還包括在人類腸道,動物腸道或土壤中定居的細菌或任何您能想到的東西。

“這可能會解決各種實踐對產生抗生素耐藥性的不同貢獻的爭論。

“如果您去中低收入國家,抗生素耐藥性確實是一個巨大的臨床問題,而且成本很高。如果我們可以通過這項研究至少使一些人相信,嘗試解決潛在的潛在問題是一項很好的投資。產生抗生素抗藥性的原因,而不是(僅僅)試圖改善醫院患者的治療方法,這將是一個很好的政策結果。”


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