宏基因組學作為確定農業管理實踐如何影響人類和動物健康的有力工具而受到關注，特別是在促進抗生素耐藥性傳播的潛力方面。然而，如果不對已發布的數據集進行完整的重新分析，就不可能比較多個研究和環境中抗生素抗性基因 (ARG) 的分布和流行程度。

在 NIFA 的支持下，弗吉尼亞理工大學的研究人員創建了AgroSeekundefined，這是一個基于網絡的集中式系統，提供分析和比較宏基因組數據集的工具，專門為研究人員和農業部門的其他用戶定制，這些用戶對跟蹤和減輕 ARGs 的傳播感興趣.AgroSeek 利用用戶提供的豐富的宏基因組數據和元數據，以用戶友好的方式促進分析、比較和預測。AgroSeek 從公共數據集中提取數據，為數據分析提供比較點和背景。

這種易于使用的工具還為宏基因組數據共享和協作創造了空間，以協助決策者、利益相關者和公眾進行決策。

田納西大學科學家開發出家禽抗生素替代品

2017 年，FDA 逐步停止在食用動物的動物生產中使用飼料中具有重要醫學意義的抗生素來促進生長。由于這項 FDA 法規，農業中的 AMR 細菌立即顯著減少，而人類的 AMR 細菌沒有變化。然而，限制抗生素使用會損害生產效率和動物健康。因此，迫切需要開發有效的抗生素替代品。

田納西大學的科學家們開發了兩種創新的小分子，即膽鹽水解酶抑制劑和宿主防御肽誘導化合物，作為抗生素的替代品，用于家禽的生長促進和疾病控制。然后，他們使用創新且具有成本效益的封裝技術來進一步提高這些天然化合物在商業應用中的有效性。

作為這項工作的結果，研究人員發現丁酸鹽和毛喉素在增強先天免疫、屏障功能和抗病能力方面具有很強的協同作用，而不會引發炎癥細胞因子基因表達。他們發現丁酸鹽、毛喉素和乳糖在促進先天免疫和抗病性方面具有很強的協同作用。他們發現丁酸鹽和糖在誘導宿主防御肽基因表達方面具有很強的協同作用。他們還發現丁酸鹽和環氧合酶 2 抑制劑之間存在很強的協同作用，可誘導宿主防御肽基因表達。

研究人員預計該項目將導致開發兩種創新的非抗生素喂養技術，以便在家禽和可能的其他牲畜中立即采用和商業化，從而減輕整個食物鏈的 AMR。